Cygwin ist eine Emulation der Unix-API unter verschiedenen Versionen von Microsoft Windows, auf deren Basis eine Vielzahl von Programmen aus der Unix-Welt unter Microsoft Windows bereitgestellt werden kann. Mit Cygwin lassen sich Programme, die üblicherweise unter POSIX-Systemen wie GNU/Linux, BSD und Unix laufen, auf Microsoft Windows portieren.
Mittels Cygwin portierte Programme laufen unter Windows NT, Windows 2000, Windows XP, Windows Vista und Windows Server 2003. Einige Programme laufen auch unter Windows 95 und Windows 98.
Cygwin übersetzt die Systemaufrufe der Unix-Programme in für Windows verständliche Befehle. Auf diese Art und Weise merken weder die Unix-Programme, dass sie genau genommen mit Windows kommunizieren, noch Windows, dass es Programme aus der Unix-Welt ausführt.
Wer auch unter Windows nicht auf Bash & Co. verzichten möchte, ist mit Cygwin gut beraten.
Seit geraumer Zeit ist auch XFree86 auf die Cygwin-Umgebung portiert, so daß unter Windows ein freier XServer zur Verfügung steht. Ein gute Alternative zu Exceed oder StarWin32.